学校于2009年11月正式成立工会，即广西工学院鹿山学院工会，隶属广西工学院工会管理，属广西工学院基层工会组织，合署于学校组织宣传部。2012年，随着广西工学院更名为广西科技大学，我校工会随即也变更为“广西科技大学鹿山学院工会”。2020年学校成功转设后，2021年经学校研究，报董事会同意，确定工会以学校二层独立机构进行单独设置，工会组织隶属柳州市教育工会直管。